본 화공생물공학과에서는 본교 및 공과대학의 교육목적을 바탕으로 하여 지혜의 체득과 자비의 정신을 고양시켜 세계화와 급속히 변하는 정보화 사회에 대비하고 21세기를 능동적으로 이끌어 나갈 수 있는 미래지향적인 공학 인재를 양성한다. 이를 위하여 화공생물공학 관련 제반 산업시설을 안전하고 경제적이며 환경 친화적인 방법으로 설계ㆍ운전하고 유지ㆍ관리하며, 화공생물공학의 기초지식과 이론을 바탕으로 창의적인 연구 및 응용능력을 발휘할 수 있는 우수한 기술능력과 도덕적 책임의식 및 협동심을 갖춘 국제수준의 화공생물공학 전문인을 양성함을 교육목적으로 한다. 이와 같은 본 화공생물공학과의 교육목적을 효율적으로 달성하기 위하여 다음과 같은 구체적인 교육목표를 설정하였다.

1.화공생물공학 전반의 현장에서 제반 문제점을 이해ㆍ분석하고 이를 해결할 수 있는 전문 지식을 갖춤으로써 산업현장에서 실무 및 연구개발 능력을 발휘할 수 있는 인재를 양성시킨다.
2.올바른 직업윤리와 사회적 책임감을 함양하여 팀의 다른 구성원과 의사소통을 원활히 하고 협동심을 발휘할 수 있도록 교육한다.
3.국제적으로 외국 전문가와 협동할 수 있는 영어 능력을 갖춘 공학도를 양성시킨다.

화공생물공학과에서는 세상에서 일어나는 다양한 자연과학 현상들을 이해하고 이러한 현상이 어떻게 발생하는지를 설명하기 위하여 화학, 수학, 컴퓨터, 생명 등의 기초학문을 배우며, 여러 가지 현상들을 산업화에 응용하여 어떻게 인류문명의 발전에 기여할 수 있는지에 대한 기본적인 내용을 배운다. 화공엔지니어들은 학문에 대한 근본적인 이해와 더불어 이를 실제로 구현하여 제품을 생산해내는 모든 과정을 거치게 되면서 폭 넓은 경험을 하게 된다. 또한 이를 바탕으로 원하는 화학공정을 구현하기 위해 공장과 장치의 사양을 고안해내고, 공장을 설계하며 이러한 시설들을 가동시킨다.

화공생물공학은 인류의 역사를 통하여 동력원으로서 각종 에너지 자원을 개발하고, 생활에 필요한 재료를 얻는 방법을 찾고, 인류를 괴롭히는 질병을 퇴치하는 의약품을 만들어내는 등 거의 모든 분야에서 인류가 당면한 문제를 해결하는데 핵심적인 역할을 수행해왔다. 우리나라의 경우 1960~70년대의 중화학공업발전과정을 통해 경제발전을 이루는데 지대한 공헌을 하였고, 21세기에는 그 동안 볼 수 없었던 완전히 다른 개념의 새로운 세상을 펼쳐 나갈 전자･정보기술, 나노기술, 생명공학기술, 에너지 및 환경기술을 이끌어 나가는 근간으로 활약하게 될 것이다.

화공생물공학은 기존의 정유, 석유 화학분야로부터 의학, 전자재료, 환경, 신소재 등의 분야로 활동 영역을 확대하고 있으며, 정보기술/바이오기술/나노기술/환경기술의 융합에 주도적인 역할을 하며, 또한 이러한 분양에서 대량 생산 기술을 다룰 수 있어 21세기를 주도해 나갈 융합시스템 학문으로 정립되어가고 있다. 미래의 화공생물공학 분야는 크게 (1)Bio Technology (생명공학), (2)IT Materials(정보전자소재), (3)Nano Technology (나노기술) (4)Energy/Environment (에너지/환경), (5)Computation and Systems (전산 및 시스템), (6) 이들의 복합된 분야로 나눌 수 있다.

화공생물공학은 생물학, 화학, 물리학, 수학 등의 기초과학과 물질 및 생체에너지의 활용과 이용, 그리고 생산기술을 연결하는 중요한 교량적 역할을 하여 왔다. 화공생물공학에서 다루는 분야로서는 생명 및 화학제품의 제조 및 분리, 고분자를 포함한 신소재, 에너지와 자원, 생물공학, 환경산업 등 다양하게 예를 들 수 있다. 이러한 다양한 학문적 특성 때문에 화공생물공학은 높은 시대적 적응력을 갖게 되어 급변하는 기술변화에 능동적으로 대처할 수 있어서 생의약 및 생명산업, 전자 및 광재료, 미세구조재료, 안전관리, 환경문제, 공정자동화, 연료 및 에너지 산업 분야 등에서 크게 기여하며 사회적 요구에도 적극 부응하고 있다. 이러한 다양한 분야에서 화공생물공학 프로그램을 전공한 학생들은 크게 졸업 후 전문적 지식이 요구되는 공정기술분야와 일반관리분야로 진출할 수 있다.

1.공정기술분야
- 설계공학 : 생명 및 화학공정의 기본개념을 이해하고 목적에 맞는 공정 혹은 장치를 설계
- 기획설계공학 : 새로운 공장의 건설을 처음부터 끝까지 설계 및 관리
- 생산관리 : 필요로 하는 제품을 안전하고 효율적으로 생산하기 위한 생산요소들의 관리
- 플랜트 엔지니어링 : 공정의 문제 해결과 개선, 수정을 통한 기술적인 지원
- 연구개발 : 연구실에서 개발된 새로운 연구들의 산업화

2.일반관리분야
- 재정, 경영 : 공정산업의 경제적 분석 및 경영관련 불확실 요소들의 이해와 분석
- 기술영업, 기획 : 공정산업으로부터 생산된 제품의 판매와 기술적 지원 및 신규사업 진출방향 모색